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Nun, das wird ganz vom dem package selbst abhängen.

Wie Software sich ins System einspielt, bleibt dem Geschmack jedes Herstellers überlassen. Da gibt es zig Möglichkeiten. Am Gängigsten ist der GNU-Autotool-3er: "./configure; make; make install". Falls deine Software sich so eingespielt kannst du mit "make uninstall" das Teile in der Regel weider entfernen.

Allerdings müssen diese Funktionen natürlich vom Hersteller entsprechend gewartet und gepfelgt sein. Eine Garantie, das *der* das alles von Haus aus richtig gemacht hat, gibt es nicht.

Gentoo baut hier einen Art "Wrapper" drum-herum mit dem du immer in gleicher Art und Weise Software einspielen und wieder entfernen kannst. Außerdem sollten durch die Gentoo-Developer sicher gestellt sein, das auch wieder alles entfernt wird, was eingespielt wurde.

... da du es manuell gemacht hast, bleibt dir wohl nichts anderes übrig als entsprechende READMEs zu der Software zu lesen ...

Wahrscheinlich wird der Atitreiber auch eine ausführbare Datei sein wie beim Nvidia-Treiber.
Ich würde mal probieren, um die entsprechende Option rauszubekommen. (Oder auch --h , -h , -help ). Das sollte irgendwas sein wie
.

@derlu: hat sich was getan? Hast du es geschafft? ... und kann man den Thread abschließen via "[gelöst]"?