Mit Thunderbird kannst du Standardmässig schon Nachrichtenregeln erstellen, also neue Nachrichten mit Betreff oder Absender X in den Ordner Y verschieben lassen. Zugegeben, unter meinem neuen Gentoo hab ich es noch nicht eingestellt und so getestet, hole ich heute aber nach.
Und die selbstlernenden Ordner bei Opera hören sich interessant an, ich hab das Mailprogramm nie genutzt weil es mir zu simpel erschien, vielleicht habe ich mich getäuscht?