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habe ja schon lange nicht mehr gegenkernelt, aber beim normalen Kernel kopiere ich die .config in /usr/src/linux und mache ein make oldconfig
danach frißt der Kernel auch die neuen Settings. Wenn sich was ändert, oder was neu hinzukommt fragt er mich dann sogar ab, wie er verfahren soll. Das mag beim genkernel anders sein.
Aber genkernel --help hatte mir damals auch geholfen.